raport z analizy danych dotyczących raka piersi w podziale na grupy wiekowe
Celem tego raportu jest przeprowadzenie dogłębnej analizy danych dotyczących pacjentek cierpiących na raka piersi. Dane wykorzystane w analizie zostały pozyskane ze źródła o uznanej wiarygodności – platformy Kaggle, dostarczając jednocześnie linki do pełnego opisu danych tutaj oraz samego zbioru danych tutaj.
Pełny raport w wersji opisowej znajduje się tutaj, natomiast przygotowany plik w Arkuszach Google wraz z wykonanymi analizami znajduje się tutaj.
Analiza tych danych ma na celu nie tylko poznanie głównych charakterystyk pacjentek dotkniętych tym ciężkim schorzeniem, ale także zgłębienie zrozumienia różnorodnych czynników, które wpływają na ryzyko nawrotu raka piersi.
W niniejszym raporcie skupimy się na szczegółowej analizie kluczowych zmiennych, takich jak wiek pacjentek, ich status menopauzalny, rozmiar guza, stopień złośliwości, położenie guza na piersi, stosowanie radioterapii oraz, co jest szczególnie istotne, wyniki klasyfikacji nawrotu choroby.
Opis Danych
Dane te stanowią cenny zasób informacji, który może wesprzeć pracę lekarzy i badaczy w podejmowaniu bardziej efektywnych decyzji diagnostycznych i terapeutycznych w walce z rakiem piersi. Ostatecznie, nasza analiza może przyczynić się do poprawy opieki nad pacjentkami oraz do zwiększenia zrozumienia mechanizmów, które leżą u podstaw tej choroby, co jest kluczowe w kontekście walki z nią.
Dane obejmują informacje dotyczące 277 pacjentek. Każda pacjentka jest opisana za pomocą 9 zmiennych oraz wyniku klasyfikacji (recurrence-events lub 0-recurrence-events). Poniżej przedstawiam opis poszczególnych zmiennych:
age: Wiek pacjentki (kategoria wiekowa)
menopause: Status menopauzy (0 – nie, 1 – tak po 40, 2 – tak przed 40)
tumor-size: Rozmiar guza (kategoria rozmiaru)
inv-nodes: Liczba zajętych węzłów chłonnych (kategoria liczby węzłów)
node-caps: Inwazja torebki węzła chłonnego (0 – nie, 1 – tak)
deg-malig: Stopień złośliwości (kategoria stopnia)
breast: Położenie guza na piersi (right – prawa, left – lewa)
breast-quad: Czworokątna lokalizacja guza na piersi (kategoria lokalizacji)
irradiate: Stosowanie radioterapii (0 – nie, 1 – tak)
class: Wynik klasyfikacji (recurrence-events – nawrót raka, 0-recurrence-events – brak nawrotu)
ANALIZA WIEKOWA PACJENTEK
Pierwsza analiza koncentruje się na wieku pacjentek. Średni wiek wynosi około 51 lat przy przyjęciu dla grupy 50-59 lat średniego wieku 55 lat. Najmłodsza pacjentka należała do grupy 20-29 lat, a najstarsza do grupy 70-79 lat liczącej 6 osób. Największa liczba pacjentek mieści się w kategorii wiekowej 50-59 lat.
Analiza Menopauzy
Analiza menopauzy wykazała, że większość pacjentek nie była w czasie badania w okresie menopauzy.
Analizując te dane, można zauważyć, że menopauza jest zjawiskiem, które występuje częściej u kobiet w wieku 40-49 lat i 50-59 lat, gdzie odpowiednio 28,32% i 20,63% badanych przeszło menopauzę po 40 roku życia. W grupie wiekowej 30-39 lat menopauza jest rzadka, wystąpiła tylko u jednej osoby.
Warto również zauważyć, że w grupach wiekowych 20-29 lat i 30-39 lat menopauza przed 40 rokiem życia jest bardzo rzadka, występująca tylko u jednej osoby.
Analizując wpływ menopauzy na nawroty raka w różnych grupach wiekowych można zauważyć:
Wiek 20-29:
- W tej grupie wiekowej jest tylko jedna osoba.
- Ta osoba nie miała nawrotu nowotworu.
- Procent osób bez nawrotu względem grupy wiekowej wynosi 100%.
- Procent osób bez nawrotu względem wszystkich wynosi 0%.
Wiek 30-39:
- W tej grupie wiekowej jest 36 osób.
- 35 osób nie miało nawrotu nowotworu.
- 1 osoba miała nawrót nowotworu.
- Procent osób z nawrotem względem grupy wiekowej wynosi 42%.
- Procent osób z nawrotem względem wszystkich wynosi 5%.
- 21 osób nie miało nawrotu nowotworu.
- Procent osób bez nawrotu względem grupy wiekowej wynosi 58%.
- Procent osób bez nawrotu względem wszystkich wynosi 7%.
Wiek 40-49:
- W tej grupie wiekowej jest 90 osób.
- 81 osób nie miało nawrotu nowotworu.
- 9 osób miało nawrót nowotworu.
- Procent osób z nawrotem względem grupy wiekowej wynosi 30%.
- Procent osób z nawrotem względem wszystkich wynosi 9%.
- 63 osób nie miało nawrotu nowotworu.
- Procent osób bez nawrotu względem grupy wiekowej wynosi 70%.
- Procent osób bez nawrotu względem wszystkich wynosi 22%.
Wiek 50-59:
- W tej grupie wiekowej jest 96 osób.
- 33 osoby nie miały nawrotu nowotworu.
- 4 osoby miały nawrót nowotworu przed menopauzą.
- 59 osób miało nawrót nowotworu po 40 roku życia.
- Procent osób z nawrotem względem grupy wiekowej wynosi 26%.
- Procent osób z nawrotem względem wszystkich wynosi 9%.
- 71 osób nie miało nawrotu nowotworu.
- Procent osób bez nawrotu względem grupy wiekowej wynosi 74%.
- Procent osób bez nawrotu względem wszystkich wynosi 25%.
Wiek 60-69:
- W tej grupie wiekowej jest 57 osób.
- 2 osoby miały nawrót nowotworu przed menopauzą.
- 55 osób miało nawrót nowotworu po 40 roku życia.
- Procent osób z nawrotem względem grupy wiekowej wynosi 30%.
- Procent osób z nawrotem względem wszystkich wynosi 6%.
- 40 osób nie miało nawrotu nowotworu.
- Procent osób bez nawrotu względem grupy wiekowej wynosi 70%.
- Procent osób bez nawrotu względem wszystkich wynosi 14%.
Wiek 70-79:
- W tej grupie wiekowej jest 6 osób.
- 6 osób miało nawrót nowotworu po 40 roku życia.
- Procent osób z nawrotem względem grupy wiekowej wynosi 17%.
- Procent osób z nawrotem względem wszystkich wynosi 0%.
- 5 osób nie miało nawrotu nowotworu.
- Procent osób bez nawrotu względem grupy wiekowej wynosi 83%.
- Procent osób bez nawrotu względem wszystkich wynosi 2%.
Podsumowując, można zauważyć, że nawroty nowotworu występują częściej u osób po 40 roku życia niż przed nim. Najwięcej nawrotów występuje w grupie wiekowej 50-59 lat (30%), zarówno przed menopauzą, jak i po 40 roku życia. W grupach wiekowych 20-29 lat i 70-79 lat nawroty nowotworu są rzadkie. Procent osób bez nawrotu nowotworu jest wyższy w grupach wiekowych młodszych niż 60 lat, zwłaszcza w wieku 20-29 lat i 30-39 lat.
Procent osób bez nawrotu względem wszystkich wynosi 70,28%, podczas gdy procent osób z nawrotem wynosi 29,72%.
Powyższy wykres wizualizuje jak rozkładają się dane dotyczące wystąpienia menopauzy i kiedy w porównaniu do wszystkich osób występujących w danej grupie wiekowej.
Powyższy wykres ukazuje jak wygląda rozkład wystąpienia lub nie menopauzy u kobiet w różnych grupach wiekowych na tle wystąpienia lub nie nawrotu nowotworu raka piersi. Można zauważyć, że wystąpienie menopauzy nie wpływa na nawrót nowotworu raka piersi. Wskaźnik korelacji tych zmiennych wynosi -0,05, czyli jest bardzo słaby.
Analiza Rozmiaru Guza
Rozmiar guza jest zróżnicowany, ale przeważają guzy o średnich rozmiarach o wielkościach między 20-34, których wykazano łącznie 56,99% pośród pozostałych mniejszych (0-19) i większych (34-54). Najbardziej liczną kategorią okazała się ta z nowotworem o wielkości 30-34 mm, która stanowiła 20,98% wszystkich pozostałych.
Guzy o wielkości 10-14 mm i 15-19 mm są najczęściej występującymi w badanych grupach wiekowych, stanowiąc odpowiednio 9,44% i 10,14% wszystkich przypadków.
Grupa wiekowa 50-59 lat wykazuje najwyższy odsetek guzów o wielkości 20-24 mm (7,34%) i 25-29 mm (7,34%). Jest to grupa wiekowa, w której guzy większe niż 20 mm występują stosunkowo często.
W grupach wiekowych 20-29 lat i 30-39 lat guzy większe niż 20 mm są rzadkością. W obu tych grupach wiekowych odsetek wynosi zaledwie 0,35%.
Wiek może wpływać na rozmiar guza, ponieważ odsetek guzów o wielkości 10-14 mm i 15-19 mm wzrasta wraz z wiekiem, osiągając maksimum w grupie wiekowej 50-59 lat. Jednak guzy większe niż 20 mm nie wykazują wyraźnego trendu wzrostowego wraz z wiekiem.
Ogólny trend w badanych grupach wiekowych wskazuje, że mniejsze guzy są bardziej powszechne niż większe guzy. Jednak w grupie wiekowej 50-59 lat występuje pewna liczba większych guzów.
Analiza Stopnia Złośliwości
Stopień złośliwości guza jest zmiennej kategorialnej. Większość guzów miała stopień złośliwości 2, co oznacza umiarkowaną złośliwość.
Analizując powyższą tabelę można zauważyć, że najwięcej guzów złośliwych (32%) występuje w grupie wiekowej 50-59 lat. W grupie wiekowej 40-49 lat również obserwuje się znaczną liczbę guzów złośliwych (24%), co stanowi drugi najwyższy odsetek wśród wszystkich grup wiekowych. Grupy wiekowe 30-39 lat i 60-69 lat również wykazują znaczną liczbę guzów złośliwych, odpowiednio 17% i 24% wszystkich przypadków. Najmniejszy odsetek guzów złośliwych (4%) obserwuje się w grupie wiekowej 70-79 lat, co jest spodziewane, ponieważ to grupa wiekowa, w której występuje mniejsza liczba przypadków i guzy złośliwe są mniej powszechne.
Guzy złośliwe o stopniu 2 (130 przypadków) stanowią największą część wszystkich guzów w badanej próbie, co stanowi 45% wszystkich przypadków. Guzy złośliwe o stopniu 1 stanowią 25% wszystkich przypadków, podczas gdy guzy o stopniu 3 stanowią 30% wszystkich przypadków.
Warto zauważyć, że w każdej grupie wiekowej występują guzy o różnym stopniu złośliwości. Wartość tej analizy polega na zrozumieniu rozkładu złośliwości guzów w kontekście wieku pacjentów, co może mieć wpływ na strategie leczenia i prognozy.
Te wyniki sugerują, że wiek pacjentów może wpływać na złośliwość guza, ale nie jest to jedyny czynnik determinujący, ponieważ w każdej grupie wiekowej występują guzy o różnym stopniu złośliwości.
Analizując powyższą tabelę można zauważyć, że wśród pacjentów, u których wystąpił nawrót nowotworu (71 przypadków), przeważają guzy o stopniu złośliwości 3 (45 przypadków), co stanowi 63% wszystkich przypadków nawrotu nowotworu. Guzy o stopniu złośliwości 2 stanowią 28% przypadków nawrotu nowotworu, natomiast guzy o stopniu 1 stanowią 9% przypadków nawrotu.
W przypadku pacjentów, u których nie wystąpił nawrót nowotworu (215 przypadków), guzy o stopniu złośliwości 2 stanowią największą część (102 przypadki), co stanowi 47% wszystkich przypadków braku nawrotu. Guzy o stopniu złośliwości 3 stanowią 19% przypadków braku nawrotu, natomiast guzy o stopniu 1 stanowią 9% przypadków.
Przy uwzględnieniu całej próby, guzy o stopniu złośliwości 3 stanowią największą część (37%) wszystkich przypadków złośliwych guzów, guzy o stopniu 2 stanowią 45%, a guzy o stopniu 1 stanowią 18%.
Analiza ta sugeruje, że wystąpienie nawrotu nowotworu jest powiązane z wyższym stopniem złośliwości guza. Guzy o stopniu 3 są bardziej prawdopodobne u pacjentów, u których wystąpił nawrót, podczas gdy guzy o stopniu 2 i 1 są bardziej powszechne u pacjentów, u których nie wystąpił nawrót. Wartość tej analizy polega na identyfikacji związku między nawrotem a złośliwością guza, co może mieć wpływ na dalsze strategie leczenia i prognozy.
Analiza Położenia Guza na Piersi
Guzy są równomiernie rozłożone między prawą i lewą pierś. Jednak lokalizacja na piersi (breast-quad) jest bardziej zróżnicowana, z przewagą górnej części piersi (left_low).
Analiza procentowa posadowienia guza na piersi w podziale na jego wielkość prezentuje procentowy podział guzów piersi w zależności od ich lokalizacji.
Najczęstszą lokalizacją guzów piersi w badanej próbie jest obszar „right_up” (11,54%), co oznacza, że guzy te znajdują się w prawej górnej części piersi. Kolejną częstą lokalizacją jest obszar „left_low” (38,46%), co oznacza, że guzy te znajdują się w lewej dolnej części piersi. W obszarze „left_up” (33,92%) również znajduje się znacząca liczba guzów piersi, co oznacza, że guzy te umiejscawiają się w lewej górnej części piersi. W pozostałych obszarach (central, right_low) występują guzy znacznie rzadziej w porównaniu do wyżej wymienionych obszarów.
Guzy o różnych rozmiarach wykazują różne preferencje co do lokalizacji. Na przykład, guzy o wielkości 25-29 mm wydają się częściej lokalizować w obszarze „left_low” i „left_up,” podczas gdy guzy o rozmiarze 15-19 mm są bardziej równomiernie rozprowadzone między różnymi obszarami piersi.
Sumując procenty w poszczególnych kategoriach, można zauważyć, że większość guzów umiejscawia się w obszarach lewej dolnej, lewej górnej i prawej górnej części piersi.
Analiza ta dostarcza informacji na temat preferencji lokalizacyjnych guzów piersi w zależności od ich wielkości. Może to być przydatne w diagnostyce, planowaniu leczenia i ocenie ryzyka dla pacjentek z guzami piersi.
Analiza procentowa wielkości guza w lewej piersi w podziale na grupy wiekowe wykazuje, że guzy o rozmiarze 50-59 mm stanowią największą część (19,58%) w tej grupie wiekowej. W grupie wiekowej 40-49 lat, guzy o rozmiarze 15-19 mm są stosunkowo częste (3,15%). W grupie wiekowej 60-69 lat guzy o rozmiarze 10-14 mm są najczęściej występującym typem (2,80%).
W ogólnym podsumowaniu, guzy o rozmiarze 50-59 mm stanowią znaczną część ogółu (19,58%), a guzy o mniejszych rozmiarach (15-19 mm i 10-14 mm) także mają pewne znaczenie (łącznie 5,24%).
Analiza procentowa wielkości guza w prawej piersi w podziale na grupy wiekowe wykazuje, że w grupie wiekowej 40-49 lat guzy o rozmiarze 15-19 mm stanowią znaczący odsetek (4,20%). Guzy o rozmiarze 10-14 mm są także stosunkowo często występujące w grupie wiekowej 40-49 lat (3,15%). W grupie wiekowej 50-59 lat guzy o rozmiarze 50-54 mm mają znaczący udział (13,99%).
Podsumowując, guzy o rozmiarze 15-19 mm i 10-14 mm są często obserwowane w różnych grupach wiekowych, a największy odsetek guzów o rozmiarze 50-54 mm występuje w grupie wiekowej 50-59 lat.
Powyższe wykresy obrazują dane z obu powyżej opisanych i przeanalizowanych tabel wizualizując rozkład procentowy występowania guza o danej wielkości w podziale na wiek uczestniczek badania osobno dla obu piersi.
Analiza Radioterapii
Analiza grup wiekowych w kontekście raka piersi i leczenia radioterapią przedstawia się następująco:
- W grupie wiekowej 40-49 lat i 50-59 lat znajduje się najwięcej chorych na raka piersi, odpowiednio 90 (31,47%) i 96 (33,57%) osób. W grupach wiekowych 30-39 lat i 60-69 lat również występuje znaczna liczba chorych, wynosząca odpowiednio 36 (12,59%) i 57 (19,93%) osób.
- Najwięcej osób przeszło radioterapię w grupie wiekowej 40-49 lat (26 osób, co stanowi 29% tej grupy wiekowej). W pozostałych grupach wiekowych odsetek pacjentów po radioterapii jest niższy, ale nadal znaczący.
- Najwyższy procent nawrotów nowotworu wystąpił w grupie wiekowej 30-39 lat (15 nawrotów, co stanowi 42% tej grupy wiekowej). Jednak ogólny odsetek nawrotów wśród wszystkich pacjentów wynosi 23,78%. Warto zauważyć, że nawroty są obecne we wszystkich grupach wiekowych, ale w różnym stopniu.
- Najwięcej pacjentów bez nawrotu nowotworu można zaobserwować w grupie wiekowej 50-59 lat (71 osób, co stanowi 74% tej grupy wiekowej). Ogólny odsetek pacjentów bez nawrotu wynosi 70,28%.
Analiza ta może pomóc w zrozumieniu wpływu wieku i radioterapii na nawrót raka piersi. Wydaje się, że grupy wiekowe 30-39 lat i 40-49 lat mają wyższy odsetek nawrotów, ale grupa wiekowa 50-59 lat osiąga wyższy odsetek pacjentów bez nawrotu, co może być istotne w planowaniu leczenia i opiece nad pacjentami z rakiem piersi.
Analizując powyższy wykres można zauważyć, że radioterapia nie miała większego wpływu na nawrót nowotworu. Dodatkowo, korelacja tych danych jest na poziomie 0,19, co oznacza bardzo słaby związek między danymi.
Analiza Wyników Klasyfikacji
Wyniki klasyfikacji są zróżnicowane. Około 23% pacjentek miało nawrót raka piersi (recurrence-events), podczas gdy reszta pacjentek nie miała nawrotu (0-recurrence-events).
Powyższa tabela pokazuje jak w podziale na wiek rozkładał się wynik nawrotu nowotworu.
W grupie wiekowej 40-49 lat występuje najwięcej przypadków nawrotu nowotworu (27 przypadków), co stanowi znaczący odsetek tej grupy wiekowej. Następnie grupy wiekowe 50-59 lat (25 przypadków) oraz 30-39 lat (15 przypadków) również mają istotne liczby nawrotów. W grupie wiekowej 70-79 lat występuje tylko 1 przypadek nawrotu.
Najwięcej przypadków braku nawrotu nowotworu obserwuje się w grupach wiekowych 40-49 lat (63 przypadki) oraz 50-59 lat (71 przypadków), co stanowi znaczny odsetek tych grup wiekowych.
Łącznie w badanej populacji wystąpiło 85 nawrotów nowotworu i 201 przypadków braku nawrotu.
Analiza ta pokazuje, że nawrót nowotworu raka piersi zależy w pewnym stopniu od wieku pacjentek. Grupy wiekowe 40-49 lat i 50-59 lat wydają się mieć zarówno większą liczbę nawrotów, jak i większą liczbę przypadków braku nawrotu.
Podsumowanie
Powyższy raport przeprowadza szczegółową analizę danych dotyczących pacjentek cierpiących na raka piersi. Dane te pochodzą z platformy Kaggle i obejmują informacje o 277 pacjentkach, w tym takie zmienne jak wiek, status menopauzy, rozmiar guza, liczba zajętych węzłów chłonnych, inwazja torebki węzła chłonnego, stopień złośliwości, położenie guza na piersi, stosowanie radioterapii oraz wynik klasyfikacji nawrotu choroby.
Raport rozpoczyna się od wprowadzenia, gdzie określa się cel analizy danych, którym jest poznanie charakterystyk pacjentek z rakiem piersi oraz zrozumienie czynników wpływających na ryzyko nawrotu tej choroby. Wskazuje się także na źródło danych – platformę Kaggle.
Następnie raport przeprowadza analizę wieku pacjentek, podkreślając, że najwięcej pacjentek mieści się w grupie wiekowej 50-59 lat, a najmłodsza pacjentka należała do grupy 20-29 lat. Analiza menopauzy ukazuje, że menopauza jest częstsza u kobiet w wieku 40-49 lat i 50-59 lat.
Kolejna sekcja raportu dotyczy analizy rozmiaru guza. Wykazuje, że przeważają guzy o średnich rozmiarach, szczególnie te o wielkości 30-34 mm. Analiza ta pomaga zrozumieć preferencje lokalizacyjne guzów w zależności od ich rozmiaru.
Następnie raport analizuje stopień złośliwości guza, wykazując, że guzy o stopniu 2 były najczęstsze, szczególnie w grupie wiekowej 50-59 lat. Pokazuje również, że wystąpienie nawrotu nowotworu jest powiązane z wyższym stopniem złośliwości guza.
Kolejny obszar analizy koncentruje się na położeniu guza na piersi. Raport wykazuje, że guzy były równomiernie rozłożone między prawą a lewą pierś, ale lokalizacja na piersi była bardziej zróżnicowana, z przewagą górnej części piersi.
Warto zauważyć, że raport dostarcza nie tylko opisów wyników analizy, ale także wizualizacji, takich jak wykresy, co ułatwia zrozumienie danych.
Podsumowując, raport ten przeprowadza kompleksową analizę danych dotyczących pacjentek z rakiem piersi, badając wiek, menopauzę, rozmiar guza, stopień złośliwości, położenie guza na piersi i nawrót choroby. Te informacje mogą być cenne dla lekarzy i badaczy w podejmowaniu decyzji diagnostycznych i terapeutycznych oraz w zrozumieniu mechanizmów tej choroby.